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論文查重實際上和查毒軟件的邏輯一樣，不管是知網、萬方、維普等數據庫，還是paperpass一類的專用軟件，查重邏輯都是以被檢測文章（相當于比對樣本）與數據庫文獻（相當于病毒庫）進行比對，當然是有比對算法的，不然以知網億級文獻量的規模做全文比對不知道要到何年何月；然后以軟件定制的版式化輸出結果檢測報告。
論文查重被稱之為“學術不端檢測”，也可以說是監督學術不端行為，即對學術的嚴肅性進行規制和對剽竊行為的一種抑制，禁止論文抄襲。 目前論文查重在市場上有很多檢測系統來對論文進行查重，而且權重比較高的檢測系統也不少，就像知網、萬方、維普，它們的相同點就是都有單獨的檢測系統與數據庫，不同點就是數據庫的大小收錄文章的數量多少，這也是一個很大的差別。 還有 papertime論文檢測系統 ，獨有的實時同步檢測重復率，這是papertime查重系統最突出的優點。 我們都知道，當寫一篇論文時，經常需要參考大量的資料與文獻來最后梳理我們提出來的論題，所以會用到一些參考文獻與資料都是很正常的，論文查重可以幫助我們了解論文中引用到的數據在整篇論文中占據比例的高低，避免了因各種不當引用而導致論文大重復率高的原因。
目前論文查重在市場上有很多檢測系統來對論文進行查重，而且權重比較高的檢測系統也不少，就像知網、萬方、維普，它們的相同點就是都有單獨的檢測系統與數據庫，不同點就是數據庫的大小收錄文章的數量多少，這也是一個很大的差別。 還有 papertime論文檢測系統 ，獨有的實時同步檢測重復率，這是papertime查重系統最突出的優點。
論文查重率標準是： 博士論文查重率：5%-10% 研究生論文查重率：5%-15% 本科論文查重率：10%-20%